Звучи, эуфониум! Добро пожаловать в клуб духового оркестра старшей школы Китауджи

Юу и Харука - давние подруги, которые привыкли всегда быть вместе. При поступлении в старшие классы их рассадили за разные парты. Чтобы сохранить привычную близость, девушки предпринимают нестандартное действие, результатом которого становится появление Сакуры. Она выполняет функции хранительницы времени, отвечая за сохранность существующего мира. В её обязанности входит противодействие силам, которые стремятся изменить ход истории.

Первое задание Сакуры связано с поимкой вора Сугинами, появившегося в эпохе Эдо. Вор оказался подготовленным - с помощью вызванных им волшебниц Немо и Михару ему удалось скрыться в потоке времени. Несмотря на это, Сакуре удалось вернуть похищенное сокровище той эпохи. Дальнейшие действия должна определить организация, в которой состоит Сакура - центр сохранения исторических событий.

Мотивы вора, выбравшего именно эпоху Эдо, а также происхождение помогавших ему волшебниц остаются неясными. Последствия действий Юу и Харуки приводят к изменениям в их отношениях. Вопрос о будущем их многолетней дружбы остаётся открытым.