Ящик предложений Мэдаки: Сверхлюди

После победы над Мьюри Ундзэн студенческий совет Академии Хаконива во главе с Медаки Куроками восстановил порядок в учебном заведении. В этот период относительного спокойствия действующий директор школы инициирует тайный проект, известный как План Флакона. Его истинные цели скрыты, однако реализация плана приводит к серии аномальных событий в академии, затрагивающих как учеников, так и окружающую среду.

Основное противодействие студенческому совету оказывает группа новых учеников, именующая себя Партией тринадцати. Её возглавляет Удо Мияконодзе, обладающий значительными способностями и стремящийся к захвату власти в академии. Действия этой группы, включающей других сверхспособных подростков, систематически подрывают установленный порядок и создают прямую угрозу авторитету Медаки Куроками и её союзников - Дзэнкити Хитоёси, Коки Акунэ и Могане Кикаидзимы.

Ситуация осложняется возвращением прежнего противника, который был побеждён ранее, но теперь вновь представляет угрозу. Студенческому совету предстоит противостоять одновременно нескольким источникам опасности: скрытному плану директора, организованному сопротивлению Партии тринадцати и возродившейся старой угрозе. Исход этого конфликта определит будущее Академии Хаконива.