Детектив Конан: Худший из кошмаров

В полицейский участок Японии проникает шпион с целью похищения секретных документов, принадлежащих различным международным спецслужбам. Офицеры общественной безопасности во главе с Тору Амуро прерывают операцию. Шпиону удается скрыться на угнанном автомобиле, что приводит к преследованию по шоссе. Ситуация разрешается, когда агент ФБР Шуичи Акаи выстрелом из винтовки останавливает машину нарушителя.

На следующее утро группа посещает недавно открывшийся токийский аквариум. Там они находят раненую женщину, которая страдает от полной потери памяти и не может назвать даже своего имени. Ее мобильный телефон поврежден, а глаза имеют разный цвет. Персонажи принимают решение помочь ей и остаются с ней, чтобы выяснить ее личность и обстоятельства произошедшего.

Параллельно за развитием событий наблюдает Вермут, член тайной организации. Ее присутствие указывает на то, что появление женщины с амнезией может быть связано с более широким и скрытым конфликтом, затрагивающим интересы различных сторон.