Медуза не умеет плавать в ночи

Коеми Арараги является учеником старших классов японской школы. В прошлом он был вампиром, но сумел подавить свои инстинкты и теперь скрывает эту природу, ведя обычную жизнь. Его текущая цель - успешно сдать выпускные экзамены. В ходе одного из школьных дней он случайно активирует аномальную энергетическую воронку.

В результате инцидента в учебном классе вместе с Коеми оказывается его одноклассница, с которой у него есть неразрешенный конфликт из прошлого. К ним присоединяется ученица младших классов Оги Осино, племянница эксперта по паранормальным явлениям Мэмэ Осино. Трое учащихся начинают совместное расследование для выяснения причин возникновения воронки.

Пока герои анализируют произошедшее, через аномалию начинают проникать потусторонние сущности. Их появление создает угрозу для школы и города, что вынуждает Коеми и его спутников не только искать объяснение феномену, но и противостоять нарастающей опасности.